Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntd1Q9D995 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntd1Q9D995 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntd1Q9D995 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntd1Q9D995 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntd1Q9D995 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntd1Q9D995 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms