Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx5Q9D8U8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx5Q9D8U8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms