Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifrd2Q9D8U0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd2Q9D8U0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifrd2Q9D8U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms