Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8N1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8N1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8N1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms