Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms