Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3bQ9CZT8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms