Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR3

Tomm40l, Mitochondrial import receptor subunit TOM40B, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40lQ9CZR3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40lQ9CZR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40lQ9CZR3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms