Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snw1Q9CSN1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snw1Q9CSN1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms