Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NmbQ9CR53 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NmbQ9CR53 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms