Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Map1lc3bQ9CQV6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Map1lc3bQ9CQV6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms