Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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