Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DenrQ9CQJ6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms