Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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