Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed6Q9CQG0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed6Q9CQG0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms