Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic3Q9CQE7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms