Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5aQ9CQD1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms