Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcgf6Q99NA9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcgf6Q99NA9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcgf6Q99NA9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcgf6Q99NA9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms