Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Mrpl3Q99N95 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl3Q99N95 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Mrpl3Q99N95 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Mrpl3Q99N95 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl3Q99N95 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl3Q99N95 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms