Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epdr1Q99M71 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms