Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Smim11aQ99J19 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Smim11aQ99J19 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim11aQ99J19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Smim11aQ99J19 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Smim11aQ99J19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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