Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD9AQ99638 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms