Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSR2Q969E8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TSR2Q969E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms