Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SptssbQ925E8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms