Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med28Q920D3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms