Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms