Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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