Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelenomQ8VHC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms