Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtmr3Q8K296 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtmr3Q8K296 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms