Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne4Q8CII8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne4Q8CII8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms