Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc73Q8CDM4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms