Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc87Q8CDL9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms