Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms