Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zcchc4Q8BKW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms