Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms