Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms