Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Zbed4Q80WQ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Zbed4Q80WQ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Zbed4Q80WQ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Zbed4Q80WQ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Zbed4Q80WQ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed4Q80WQ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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