Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2aQ7TSC1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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