Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LnpkQ7TQ95 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LnpkQ7TQ95 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms