Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh1Q76I79 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms