Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sned1Q70E20 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms