Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms