Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mfsd13aQ6PDE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms