Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6PD19 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6PD19 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6PD19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6PD19 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6PD19 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q6PD19 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q6PD19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6PD19 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6PD19 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6PD19 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6PD19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6PD19 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q6PD19 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q6PD19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q6PD19 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q6PD19 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms