Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BC061212Q6P8K3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BC061212Q6P8K3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms