Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms