Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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