Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6DFW0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6DFW0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6DFW0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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