Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CltcQ68FD5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CltcQ68FD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltcQ68FD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms