Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms