Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf6Q62311 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms